针刀医学是将中医和西医的部分理论融合为一体，再创造而形成的一种新的医学理论体系。从1984年小针刀疗法通过江苏省卫生厅组织的科研鉴定，到2003年由国家中医药管理局主持的、有27所全国高等医学院校专家参加的大型鉴定会，专家们一致认为针刀疗法已经发展成为一门医学新学科，并正式命名为针刀医学。2004年，由教育部组织的有4名中西医院士参加并做出“针刀医学在理论、技术和器械等方面都是具有原创性的科研成果，特别是在诊疗技术方面达到国际领先水平”的鉴定结论，不过经历了短短20年。
　　什么是针刀医学
　　针刀医学是朱汉章教授历经30年潜心研究，吸收现代自然科学成果和国内数百名中西医专家应用其发明的小针刀疗法的实践成果，将中医和西医的部分基础理论融合为一体，再创造而形成的一种新的医学理论体系。
  　她是在辩证唯物主义哲学思想的指导下，打破中医抽象思维方式与西医形象思维方式的对立格局，以创造性的独特思维方式，将中西医两种基本理论融为一体，逐步形成的较完整的新的医学理论体系。
　　针刀医学的基础理论分为四个部分：关于闭合性手术的理论；关于慢性软组织损伤的病因病理学的新理论；关于骨质增生新的病因学理论；关于经络实质的理论。其中的每一个新理论都解决相应的一大类过去传统医学理论难以解决的问题。针刀医学有六个组成部分，即：针刀医学病理生理学，针刀医学影像学，针刀医学手法学，针刀医学诊断学，针刀医学治疗学，针刀医学护理学。这六个部分形成了较完整的针刀医学的理论体系。
　　针刀疗法来源于创新
　　针刀医学以小针刀的发明作为创新的起点，通过广泛的临床实践，一系列理论创新由此展开。
　　针刀医学认为人体具有强大自我修复能力，所以治疗时不必千方百计达到所谓“除恶务尽”的程度，而明确地提出医生的治疗任务就是将人体的各种病理变化调整到人体的自我修复能力以内，以免施加过分的治疗手段而带来并发症和后遗症。这一生理特性的认识对指导临床具有十分重要的意义。
　　针刀医学认识到，机体必须维持平衡状态才能健康，如果在任何一个方面失去平衡，就会生病甚至死亡。所以医生治病的目标是纠正人的机体在某一方面的不平衡因素，使之达到平衡，使疾病痊愈。人体内的平衡内容和方式是多种多样的，如体液平衡、力学平衡、代谢平衡、营养平衡、温度平衡、电解质平衡等等。
　　根据针刀医学的有关基础理论，特别是微观解剖学的理论，采取临床和人体骨架及尸体相对照的办法，发现许多被过去影像学所忽略的影像信息，对疾病的诊断有极为重要的意义。例如，颈椎正位片对棘突长短的变化没有引起重视。棘突变短或成一个点状，是颈椎的椎体向前下方倾斜的缘故，称之为俯旋；棘突变长是颈椎的椎体向前上方移位的缘故，称之为仰旋。双侧后关节错位是椎体旋转移位所造成的，颈椎椎体的旋转移位可以引起椎动脉受挤压，造成头晕、视力下降、上肢麻木、干呕、异常出汗等症状。治疗时只要用针刀将周围的软组织松解，用手法轻轻一推，将后关节错位纠正，这些症状就会立即缓解和消失。
　　针刀医学手法学是把中国传统手法医学用现代的科学知识加以改造，使它现代化。针刀医学手法学建立在现代的生理学、病理学、解剖学和生物力学的基础上。没有传统手法那种费时费力的问题，极大地提高了手法的疗效。
　　针刀医学的诊断学继承了中医和西医的诊断理论，既有中医的望、闻、问、切、叩诊、触诊，也有西医的X线、CT、磁共振、实验室检查、病理诊断等现代方法。针刀医学的诊断学的创新内容就在于将中医的诊断方法得来的资料用现代科学来加以分析和认识。综合运用中西医的各种诊察手段，较大地提高了诊断的精确性和准确性，减少误差。
　　针刀治疗学是根据针刀医学基础理论所阐明的原理，对各类疾病病因病理新认识的基础上所形成的，它主要的器械是针刀。针刀治疗学主要包括四个方面的内容，即针刀为主，手法为辅，药物配合，器械辅助。针刀首先是刀的治疗作用，能作多种闭合性手术。针刀对某些疾病可以发挥针的作用，但比毫针刺激量大，应激效应快，且有方向性。刀和针的综合作用使能量释放和补充，并达到平衡。
　　对大多数疾病，针刀治疗后的护理方法，都与传统的护理方法有很大的差异。例如，针刀治疗关节内骨折，在针刀复位固定后，不但不进行强行固定，而且要求护理人员每天将患肢被动屈伸1－2次，当然对不同类型的关节内骨折有不同的活动方法。
　　2005年6月，全国高等中医院校《针刀医学》系列规划教材定稿会在北京中医药大学召开。《针刀医学》系列教材的问世，标志着针刀医学从民间疗法的“游击队”正式整编入主流医学的“正规军”。20多年来，全国已接受培训的针刀医师达3万余人，有副教授、副主任医师以上职称5000余人参加了培训，他们中的一部分已成为针刀医学发展的中坚力量；部分三级甲等医院已成立独立建制的针刀临床科室。