针刀医学方向已获批准，成为国家中医药管理局重点研究室。本方向拟主要解决的实际问题包括：针刀临床治疗规范化制定；针刀治疗慢性软组织损伤和骨性关节炎的机理研究；针刀治疗疑难病研究等。北京中医药大学针刀医学中心主任郭长青教授为该方向负责人。 国家中医药管理局重点研究室是依托于科研院所、高等院校、医疗机构或企业建设，有固定人员编制和稳定研究方向，专门从事中医药研究的组织机构，是聚集多学科人才，按照中医药发展规律及学术发展需求，在重点方向或关键领域深入开展综合性中医药研究的重要基地；是组织学术交流，运用传统和现代研究方法获取原始创新和自主知识产权成果，培养卓越科技人才的重要基地；是对重点学科、重点专科、中药产业基地发挥引领支撑作用的科学研究的重要基地，是国家中医药创新体系的重要组成部分。
重点研究室的主要任务是围绕中医药事业发展的科技需求，针对制约中医药发展的关键理论问题和共性技术问题，组织开展符合中医药自身发展规律的前瞻性、纵深性及综合性研究，为理论、临床和产业发展提供支撑。
北京中医药大学针刀医学方向以针刀疗法的基础研究为研究突破口，致力于探索并总结针刀治疗的作用规律和作用机理，为针刀治疗提供理论指导。经过几年努力，针刀医学方向在行业内产生了比较大的影响。以“针刀医学发展与中医现代化”为题召开了第272次香山科学会议，肯定了针刀疗法的原创性及其疗效的国际领先水平。2002年和2005年获教育部科技进步二等奖。
在此基础上，为了进一步加强针刀疗法的基础研究工作，北京中医药大学特别组织了专门的科研团队，开展了各级研究课题的申报。到目前为止，共有3项课题成功获得国家中医药管理局资助。2005年科研课题“针刀松解法的基础研究”获得国家“973”计划资助，目前课题组正在对针刀松解法的作用机制进行深入研究。